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頭端式の終着駅ですので、旅客ホームの線路すべてに車止めがあります。 各ホームには跨線橋を通ることなく行くことができます。
同駅構内の留置線を除き、長崎運輸センター跡の線路は順次撤去されるとききます。
1905年（明治38）年4月5日 九州鉄道の駅として開業
1907年（明治40）年7月1日 国鉄の駅となる
1987年（昭和62）年4月1日 JR九州、JR貨物の駅となる
1998年（平成10）年4月1日 貨物列車の設定廃止
